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875生物信息學考試大綱
一、考試內(nèi)容范圍
生物信息學是一門綜合交叉學科,是采用信息科學、計算機科學和數(shù)學等學科的觀點和方法對生命的現(xiàn)象及其組成分子(核酸、蛋白質等)進行研究,主要研究生命中的本質和規(guī)律,包括物質組成、結構功能、生命體的能量和信息交換傳遞等。
知識結構:
★ 生物信息學概論和數(shù)據(jù)庫
★ 序列數(shù)據(jù)的收集和存儲
★ 基因組序列組裝和基因注釋
★ 基因結構元件識別和分析
★ 雙序列與多序列比對
★ 數(shù)據(jù)庫檢索算法
★ 序列變異研究的算法與進化分析
★ 基因表達與調(diào)控網(wǎng)絡
★ 表觀遺傳學數(shù)據(jù)分析
★ 蛋白質分類與結構預測
考核內(nèi)容:
了解生物信息學概念、研究方向和發(fā)展趨勢,并熟悉重要的生物信息中心和常用數(shù)據(jù)庫。
了解不同類型序列數(shù)據(jù)的獲取方式,掌握常用的序列存儲格式及轉換方式。
掌握常用序列聯(lián)配算法,了解打分矩陣及空位罰分算法,并理解多重序列比對與進化分析的關系。
理解進化分析與親緣樹的關系,掌握三種進化分析算法(最大似然法、距離法和最大簡約法)。
掌握轉錄組分析基本方法,理解基因表達差異分析的算法。
了解染色質免疫共沉淀技術,掌握ChIP-Seq數(shù)據(jù)處理流程和下游分析流程。
掌握蛋白質結構的組成和層次,理解序列相似性與結構相似性同蛋白質分類之間的關系,掌握蛋白質結構預測方法,包括二級結構和三級結構。
二、試卷結構
試卷滿分150分。序列分析算法、數(shù)據(jù)庫搜索工具、進化分析原理約占80分左右,新一代測序數(shù)據(jù)分析、表觀遺傳及相關生物信息學工具和分析等約占70分。
三、參考書目
陳銘生物信息學科學出版社2018年09月第三版
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