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      中科院新疆理化所研究生導(dǎo)師介紹:尤著宏

      分類(lèi):導(dǎo)師信息 來(lái)源:中科院新疆理化所 2018-06-08 相關(guān)院校:中科院新疆理化技術(shù)研究所

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      尤著宏,男,研究員(自然科學(xué))

      通訊地址:烏魯木齊市北京南路40號(hào)附1號(hào)

      郵政編碼:830011 

      電子郵件:zhuhongyou@ms.xjb.ac.cn

      尤著宏,男,1980年8月出生,中科院新疆理化技術(shù)研究所研究員、國(guó)科大博士生導(dǎo)師,中科院率先行動(dòng) “百人計(jì)劃”青年俊才候選人。2005年9月-2010年12月,中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)碩博連讀,獲工學(xué)博士學(xué)位;2008年6月-2009年12月,美國(guó)康奈爾大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士生;2001年9月-2005年06月,湖南師范大學(xué)本科,獲工學(xué)學(xué)士。2012年1月-2013年6月,同濟(jì)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)博士后流動(dòng)站,博士后;曾獲人社部“香江學(xué)者”計(jì)劃資助,在香港理工大學(xué)電子計(jì)算學(xué)系從事博士后研究。

      尤著宏博士主持或完成國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目3項(xiàng)(青年基金1項(xiàng),面上項(xiàng)目2項(xiàng)),博士后基金項(xiàng)目1項(xiàng)。近年來(lái)在《PLOS Computational Biology》、《Briefings in Bioinformatics》、《Bioinformatics》、《Scientific Reports》、《IEEE Transactions on Cybernetics》、《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》、《Oncotarget》等國(guó)內(nèi)外重要學(xué)術(shù)期刊及國(guó)際會(huì)議發(fā)表學(xué)術(shù)研究論文90余篇,其中SCI 索引論文69 篇,在ISBRA、IJCNN、WCCI及BIBM等國(guó)際會(huì)議上發(fā)表EI論文20余篇。論文累計(jì)影響因子超過(guò)200,其中第一作者及通訊作者SCI 索引論文48 篇。以一作或者通訊發(fā)表中科院一區(qū)論文12 篇,以一作或者通訊發(fā)表中科院二區(qū)以上論文33 篇。發(fā)表論文被Annual Review of Biophysics、 IEEE Transactions on Industrial Informatics、IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering、Behavioural Neurology、Frontiers of Computer Science、Information Sciences、Frontiers in Genetics、Trends in genetics、Briefings in Bioinformatics、Cancer research、Nucleic acids research 等國(guó)際著名雜志引用超1000次(Google Scholar),4 篇論文入選ESI 高被引論文。撰寫(xiě)專(zhuān)著章節(jié)1 章、申請(qǐng)發(fā)明專(zhuān)利5 項(xiàng)。

      尤博士目前是IEEE會(huì)員,中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)CCF計(jì)算機(jī)應(yīng)用專(zhuān)委會(huì)常委。擔(dān)任Journal of Biological Research、International Journal of Distributed Sensor Networks、Evolutionary Bioinformatics及BioMed Research International 4個(gè)SCI國(guó)際期刊的客座編委(Guest Editor),是IEEE Transactions on Industrial Informatics, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, IEEE Transactions on NanoBioscience等多個(gè)IEEE Transaction匯刊、Scientific Reports、Neurocomputing、PLOS CB等國(guó)際期刊特邀審稿人。作為第二完成人的科技成果“復(fù)雜生物數(shù)據(jù)的特征建模及高效學(xué)習(xí)理論與應(yīng)用”獲得2016年教育部自然科學(xué)獎(jiǎng)2 等獎(jiǎng)。

      主要研究領(lǐng)域及成就:

      包括基于圖像的高通量數(shù)據(jù)分析;圖及復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論及其應(yīng)用;生物信息學(xué)中蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)、藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)、microRNA與疾病關(guān)系預(yù)測(cè)、疾病相關(guān)的 miRNA-環(huán)境因子組合作用預(yù)測(cè)、非編碼RNA大規(guī)模功能類(lèi)似性網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建等。       

      代表性文章:(10篇以?xún)?nèi))

      (1) Zhu-Hong You(尤著宏), Mengchu Zhou, Xin Luo, Shuai Li,“Highly Efficient Framework for Predicting Interactions Between Proteins,” IEEE Transactions on Cybernetics, vol. 47, no.3, pp. 721-733, 2017. (SCI, 3年影響因子:4.454, 中科院1區(qū))

      (2) Zhu-Hong You(尤著宏), Zhi-An Huang, Zexuan Zhu, Gui-Ying Yan, Zhenkun Wen, Xing Chen “PBMDA: a novel and effective path-based computational model for miRNA-disease association prediction,” PLOS Computational Biology, 13 (3) :e1005455, 2017 (SCI, 3年影響因子4.679, 中科院小類(lèi)1區(qū))

      (3) Zhu-Hong You(尤著宏), Ying-Ke Lei, De-Shuang Huang, Xiaobo Zhou, “Using manifold embedding for assessing and predicting protein interactions from high-throughput experimental data,” Bioinformatics 2010, 26(21):2744-2751 (SCI,5年影響因子:6.968,中科院小區(qū)1區(qū))

      (4) Shuai Li, Zhu-Hong You(通信作者), Hongliang Guo, Xin Luo, Zhongqiu Zhao. “Inverse-free Extreme Learning Machine with Optimal Information Updating,” IEEE Transactions on Cybernetics, vol.1, no.99, pp 1-7, 2015(SCI, 3年影響因子:4.454, 中科院1區(qū))

      (5) Xing Chen , Yu-An Huang, Zhu-Hong You(通信作者), Guiying Yan, Xuesong Wang,“A Novel Approach based on KATZ measure to Predict Associations of Human Microbiota with Non-Infectious Diseases,” Bioinformatics, vol. 33, no.5, pp. 733-739, 2016. (SCI, 中科院1區(qū),影響因子:5.123, 中科院1區(qū))

      (6) Xing Chen, Chenggang Clarence Yan, Xu Zhang, Zhu-Hong You(通信作者). “Long non-coding RNAs and complex diseases: from experimental results to computational models,”Briefings in Bioinformatics, bbw060, 2016 (SCI, 影響因子 9.617,中科院1區(qū))

      (7) Jianqiang Li, Zhu-Hong You(通信作者), Xiao Li, Zhong Ming, Xing Chen, “PSPEL: In Silico Prediction of Self-interacting Proteins from Amino Acids Sequences using Ensemble Learning,” IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, doi: 10.1109/TCBB.2017.2649529, 2017(SCI, 3年影響因子:1.528, 中科院3區(qū))

      (8) Zhu-Hong You(尤著宏), Zheng Yin, Kyungsook Han, De-shuang Huang, Xiaobo Zhou, “A semi-supervised learning approach to predict synthetic genetic interactions by combining functional and topological properties of functional gene network,” BMC Bioinformatics 2010, 11:343 (SCI,5年影響因子:3.567,中科院2區(qū))

      (9) Yu-An Huang, Xing Chen , Zhu-Hong You(通信作者), De-Shuang Huang, Keith Chan.“ILNCSIM: improved lncRNA functional similarity calculation model,” Oncotarget. vol.7, no.18, pp. 25902–25914, 2016. (SCI, 3年影響因子 5.998 , 中科院大類(lèi)1區(qū))

      (10) Xin Luo, Mengchu Zhou, Shuai Li, Zhu-Hong You(尤著宏), Yunni Xia, and Qingsheng Zhu,“A Non-negative Latent Factor Model for Large-scale Sparse Matrices in Recommender Systems via Alternating Direction Method,” IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems, vol.27, no.3, pp. 579-592, (SCI, 3年影響因子:4.505, 中科院1區(qū)) 

      研究領(lǐng)域:大數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)挖掘、模式識(shí)別及在生物信息學(xué)上的應(yīng)用等方面研究

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